根据，劳动部关于印发《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》的通知[1995]309号）
     60、实行每天不超过8小时，每周不超过44小时或40小时标准工作时间制度的企业，以及经批准实行综合计算工时工作制的企业，应当按照劳动法的规定支付劳动者延长工作时间的工资报酬。全体职工已实行劳动合同制度的企业，一般管理人员（实行不定时工作制人员除外）经批准延长工作时间的，可以支付延长工作时间的工资报酬。
       62、实行综合计算工时工作制的企业职工，工作日正好是周休息日的，属于正常工作；工作日正好是法定节假日的，要依照劳动法第四十四条第（三）项的规定支付职工的工资报酬。

所以，实施综合计算工时制的用人单位，同样要向劳动者支付延时加班费（150%）和法定节假日加班费（300%）。